Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB2P29033 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms