Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms