Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms