Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DMAP28067 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms