Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms