Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms