Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLP19338 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLP19338 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLP19338 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCLP19338 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCLP19338 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCLP19338 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLP19338 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms