Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms