Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM27P14373 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM27P14373 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms