Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD8P13378 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD8P13378 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms