Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH1P12830 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms