Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEFHP12036 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEFHP12036 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEFHP12036 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms