Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms