Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD8BP10966 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD8BP10966 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD8BP10966 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms