Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms