Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L3P0CJ86 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms