Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP10P09238 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP10P09238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP10P09238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP10P09238 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms