Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSLP07711 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSLP07711 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms