Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOA1P02647 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms