Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DQB1P01920 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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