Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MATN4O95460 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MATN4O95460 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MATN4O95460 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms