Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPM2O94759 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms