Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD4O60885 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD4O60885 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRD4O60885 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRD4O60885 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRD4O60885 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms