Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DENRO43583 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DENRO43583 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DENRO43583 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms