Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms