Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms