Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms