Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E9PBE3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E9PBE3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E9PBE3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E9PBE3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms