Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms