Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM200CA6NKL6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms