Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT87PA6NCN2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms