Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTMR11A4FU01 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR11A4FU01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms