Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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IGHV3-16A0A0C4DH30 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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