Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms