Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIT1Q9Y2X7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIT1Q9Y2X7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms