Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLEC4EQ9ULY5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLEC4EQ9ULY5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLEC4EQ9ULY5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms