Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms