Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1L1Q9UHC9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms