Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms