Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARHGAP28Q9P2N2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms