Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms