Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms