Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMLHEQ9NVH6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms