Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms