Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms