Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4BQ9NPR2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms