Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP29Q9HBJ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms