Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms