Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF41Q9H4P4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF41Q9H4P4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms