Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms